由于急性丙型肝炎病毒感染通常是无症状的，很少有人在急性期诊断。在那些继续发展慢性丙肝感染，感染也往往不能确诊感染是无症状的，直到几十年后感染时，症状继发于严重肝损伤。
丙型肝炎病毒感染被诊断为2个步骤：
1、用血清学试验的抗丙型肝炎病毒抗体的筛选确定了已被感染的病毒的人。
2、如果测试抗丙肝抗体阳性，对丙型肝炎病毒核糖核酸（RNA）的核酸检测来证实慢性感染，约15–45%丙肝感染自发清除感染的强烈的免疫反应不需要治疗的人。虽然不再感染，他们仍然会测试阳性的抗丙型肝炎病毒抗体。
一个人被诊断为慢性丙型肝炎感染后，他们应该有一个评估肝损伤程度（纤维化和肝硬化）。这可以通过肝活检或通过各种非侵入性的测试。
此外，这些人应该有一个实验室测试，以确定丙型肝炎病毒株的基因型。有6种基因型的丙型肝炎病毒，他们的反应不同的治疗。此外，它是可能的一个人被感染超过1基因型。肝损伤程度和病毒基因型用于指导治疗决策和管理的疾病。
